Отслужив в рядах Советской Армии три года, вернулся на завод. Без отрыва от производства в 1973 году закончил Комсомольский-на-Амуре Политехнический институт по специальности «Самолётостроение». Практически сразу у молодого инженера, показавшего себя хорошим специалистом и организатором производства началась стремительная карьера. Путь от начальника технического бюро в цехе до генерального директора КнААПО Виктор Меркулов прошел менее чем за 30 лет. Несмотря на сложности 90-х годов прошлого столетия, под руководством Виктора Ивановича авиастроительное предприятие не только выжило, но и стало лидером отрасли, первым перешедшим на цифровое проектирование и электронный документооборот. Это в свою очередь позволило освоить производство авиационной техники на новых, для отечественного авиастроения, принципах.
Настоящий патриот своего завода и города, Виктор Иванович принял деятельное участие в развитие отечественной военной и гражданской авиации. Именно Виктору Ивановичу Меркулову принадлежит решение начать на заводе освоение производства гражданских самолётов Бе-103, Са-20П, Су-80. По инициативе Виктора Меркулова в Комсомольске-на-Амуре был запущен в производство боевой самолёт Су-30 МКК, который стал основой для целого семейства самолётов, поставлявшихся как в отечественные ВВС, так и за рубеж. Несмотря на то, что Виктор Иванович как руководитель сформировался во времена Советского Союза, деловые качества помогли ему встроить Комсомольский авиазавод в условия рынка, наладить тесное взаимодействие с органами государственной власти.
Всё эти действия помогли авиационному заводу Комсомольска-на-Амуре приступить к выпуску самой современной авиационной технике.
Сегодня гордостью отечественного авиастроения являются самолёты Су-35С и Су-57.
После завершения работы на КнААЗ, Виктор Иванович Меркулов работал в ПАО «Сухой», а по выходу на пенсию стал членом Совета старейшин Компании.
Огромный вклад Виктора Ивановича Меркулова в 1999 году оценило руководство страны, наградив его орденом «Знак Почета» и Государственной премией в области науки и техники. Земляки в 2002 году удостоили звания «Почетный гражданин Комсомольска-на-Амуре».